Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chd2E9PZM4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chd2E9PZM4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd2E9PZM4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms