Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd1E9PZ26 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd1E9PZ26 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms