Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim5E9PV98 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms