Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syde2E9PUP1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms