Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Soga1E1U8D0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms