Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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