Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms