Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Cttnbp2B9EJA2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms