Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc11B2RXC1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc11B2RXC1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms