Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfap58B2RW38 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms