Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clrn2B2RVW2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clrn2B2RVW2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms