Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Usf3B2RUQ2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Usf3B2RUQ2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms