Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zscan5bB2RTN3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms