Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf3B2RQG2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf3B2RQG2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms