Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1B2KF50 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1B2KF50 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1B2KF50 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms