Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn7aB1AYL1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn7aB1AYL1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms