Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms