Protein–RNA interactions for Protein: A6H619

Phrf1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phrf1A6H619 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phrf1A6H619 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms