Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc9bA3KGF9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc9bA3KGF9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms