Protein–RNA interactions for Protein: A2BG94

Gm6890, Predicted gene 6890, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6890A2BG94 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6890A2BG94 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm6890A2BG94 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm6890A2BG94 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm6890A2BG94 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm6890A2BG94 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm6890A2BG94 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm6890A2BG94 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm6890A2BG94 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm6890A2BG94 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6890A2BG94 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6890A2BG94 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6890A2BG94 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6890A2BG94 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6890A2BG94 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6890A2BG94 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6890A2BG94 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6890A2BG94 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6890A2BG94 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6890A2BG94 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6890A2BG94 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6890A2BG94 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6890A2BG94 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6890A2BG94 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6890A2BG94 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms