Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Upf2A2AT37 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Upf2A2AT37 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Upf2A2AT37 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Upf2A2AT37 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Upf2A2AT37 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Upf2A2AT37 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Upf2A2AT37 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms