Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Patl2A2ARM1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Patl2A2ARM1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms