Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtf1A2AQ19 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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