Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms