Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc183A2AJB1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc183A2AJB1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms