Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prdm12A2AJ77 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prdm12A2AJ77 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms