Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pramel3A2AHA7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramel3A2AHA7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms