Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rhbdl2A2AGA4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms