Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pramef6A2A8M8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms