Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIF8

Irgm2, Immunity-related GTPase family M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irgm2A0A140LIF8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irgm2A0A140LIF8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Irgm2A0A140LIF8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms