Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H0

Trbv12-1, T cell receptor beta, variable 12-1 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv12-1A0A0B4J1H0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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