Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnf4Q9QZS2 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnf4Q9QZS2 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnf4Q9QZS2 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnf4Q9QZS2 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnf4Q9QZS2 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rnf4Q9QZS2 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Rnf4Q9QZS2 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Rnf4Q9QZS2 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Rnf4Q9QZS2 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Rnf4Q9QZS2 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Rnf4Q9QZS2 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Rnf4Q9QZS2 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Rnf4Q9QZS2 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf4Q9QZS2 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnf4Q9QZS2 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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Rnf4Q9QZS2 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnf4Q9QZS2 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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