Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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Rnf6Q9DBU5 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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Rnf6Q9DBU5 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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Rnf6Q9DBU5 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Rnf6Q9DBU5 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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Rnf6Q9DBU5 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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