Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Olfr316-201ENSMUST00000203731 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm39033-201ENSMUST00000209158 1021 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm4898-201ENSMUST00000218519 832 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm23358-201ENSMUST00000103887 110 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm25608-201ENSMUST00000104021 132 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm25320-201ENSMUST00000122551 324 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Mgst1-207ENSMUST00000140932 742 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Spp2-202ENSMUST00000176708 710 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 2310008N11Rik-202ENSMUST00000210263 422 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 AC154687.1-201ENSMUST00000224875 677 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm5590-201ENSMUST00000059110 345 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Glra4-201ENSMUST00000018739 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms