Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms