Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71Q8VEG0 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms