Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms