Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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