Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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