Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Atg9aQ68FE2 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Atg9aQ68FE2 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Atg9aQ68FE2 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Atg9aQ68FE2 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Atg9aQ68FE2 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Atg9aQ68FE2 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Atg9aQ68FE2 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atg9aQ68FE2 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atg9aQ68FE2 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atg9aQ68FE2 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atg9aQ68FE2 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms