Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Prkag2os1-201ENSMUST00000134633 991 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 4930594O21Rik-202ENSMUST00000144981 682 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28968-201ENSMUST00000190413 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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Sft2d1Q5SSN7 Gm28341-201ENSMUST00000190883 472 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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Sft2d1Q5SSN7 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm7631-201ENSMUST00000196935 1100 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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Sft2d1Q5SSN7 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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Sft2d1Q5SSN7 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Cd24a-202ENSMUST00000214476 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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