Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms