Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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