Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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NcstnP57716 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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NcstnP57716 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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NcstnP57716 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
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NcstnP57716 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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NcstnP57716 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
NcstnP57716 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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NcstnP57716 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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NcstnP57716 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
NcstnP57716 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NcstnP57716 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NcstnP57716 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
NcstnP57716 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
NcstnP57716 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NcstnP57716 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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