Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 AC125190.2-201ENSMUST00000221160 497 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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