Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Zfhx3-204ENSMUST00000220518 17152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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