Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 1700039M10Rik-201ENSMUST00000180397 532 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm42959-201ENSMUST00000202184 212 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm31497-201ENSMUST00000216981 638 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Olfr518-201ENSMUST00000059617 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Dram2-203ENSMUST00000121034 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm1947-201ENSMUST00000122451 910 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm28239-201ENSMUST00000190225 447 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Cyb5r2-202ENSMUST00000208217 1178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Smim18J3QNP2 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms