Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 Pclo-202ENSMUST00000182407 16846 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 Mtf1-201ENSMUST00000030723 7631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc180J3QNE4 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ccdc180J3QNE4 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ccdc180J3QNE4 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ccdc180J3QNE4 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ccdc180J3QNE4 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ccdc180J3QNE4 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ccdc180J3QNE4 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ccdc180J3QNE4 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ccdc180J3QNE4 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ccdc180J3QNE4 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Cenpi-201ENSMUST00000081064 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Olfr96-203ENSMUST00000214482 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc180J3QNE4 Arhgef9-205ENSMUST00000113883 5399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms