Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ssxa1B1AUS7 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ssxa1B1AUS7 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ssxa1B1AUS7 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ssxa1B1AUS7 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ssxa1B1AUS7 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ssxa1B1AUS7 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ssxa1B1AUS7 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ssxa1B1AUS7 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ssxa1B1AUS7 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ssxa1B1AUS7 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ssxa1B1AUS7 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ssxa1B1AUS7 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ssxa1B1AUS7 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ssxa1B1AUS7 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ssxa1B1AUS7 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ssxa1B1AUS7 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ssxa1B1AUS7 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ssxa1B1AUS7 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ssxa1B1AUS7 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Ssxa1B1AUS7 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Ssxa1B1AUS7 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Ssxa1B1AUS7 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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Ssxa1B1AUS7 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Ssxa1B1AUS7 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ssxa1B1AUS7 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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