Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.9 ms